Process-oriented ecological modeling approach and scientific workflow system

A scientific workflow system is designed specifically to organize, manage and execute a series of research steps, or a workflow, in a given runtime environment. The vision for scientific workflow systems is that the scientists around the world can collaborate on designing global-scaled experiments, sharing the data sets, experimental processes, and results on an easy-to-use platform. Each scientist can create and execute their own workflows and view results in real-time, and then subsequently share and reuse workflows among other scientists. Two case studies, using the Kepler system and BioVeL, are introduced in this paper. Ecological niche modeling process, which is a specialized form of scientific workflow system included in both Kepler system and BioVeL, was used to describe and discuss the features, developmental trends, and problems of scientific workflows.     

番茄rin位点上的一个MADS盒基因调控果实成熟

ｒｉｎ番茄突变体的乙烯生成和果实成熟均受到抑制 ,除此之外还表现萼片增大和花序决定性丧失。尽管该突变体维持良好的乙烯敏感性 ,但果实成熟却不能被外源乙烯诱导 ,这暗示ＲＩＮ基因编码的产物同时调控依赖于和不依赖于乙烯的成熟过程。作者先前的研究已表明ｒｉｎ位点定位于番茄第 5染色体。本文报道通过定位克隆发现ｒｉｎ位点上存在两个串联的ＭＡＤＳ盒基因 ,分别定名为ＬｅＭＡＤＳ＿ＲＩＮ和ＬｅＭＡＤＳ＿ＭＣ ,前者调控果实成熟过程而后者则影响萼片先育和花序决定性。这两个基因的功能通过正义转化ｒｉｎ番茄和反义转化野生型番…     

双管基因枪介导的基因瞬时表达技术在拟南芥中的应用

基因瞬时表达是植物中研究目标基因功能的常用手段。在模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中, 相比原生质体和农杆菌介导的基因异源表达技术, 利用粒子轰击进行基因瞬时表达一直鲜有报道。其主要原因是拟南芥叶型相对较小、基因枪操作相对烦琐以及基因表达效率差异较大。该研究通过优化双管基因枪系统, 在营养生长旺盛的拟南芥莲座叶中实现GFP和GUS基因高效表达。同时, 通过GUS报告基因明确了坏死诱导因子BAX、Avh238和ATR13/Rpp13激发拟南芥细胞坏死的表型。但在本氏烟(Nicotiana benthamiana)中明显诱导细胞坏死的Avrblb1/RB基因对, 在拟南芥中却丧失了诱导细胞坏死的活性。由于双管基因枪系统每次轰击时设置平行对照, 可有效降低转化实验中的样本变异度, 为拟南芥及其突变体研究中准确评价基因功能和高通量筛选目标基因提供新的技术参考。     

食用艾蒿植物学性状和栽培技术探究——兼评《植物学》

植物学属于生物学的一门分支学科,主要研究植物的生物结构、生长形态、品种分类、生态分布及遗传进化等。人类开发、应用并保护植物资源,让植物为世界发展提供更多可能。由李扬汉主编的《植物学》是一本以认识植物学为基础,全面介绍各类植物形态特点的科学普及教材,有助于读者了解植物的多样性与功能性,认识植物对人类的重要作用,同时对于食用艾蒿植物学性状和栽培技术的相关研究具有一定的参考价值。《植物学》由上海科学技术出版社于2015年出版发行,入选“全国高等农业院校教材”。     

2型糖尿病患者脂联素、8-OHdG表达及其与认知功能的相关性

本研究旨在探究老年2型糖尿病患者血浆脂联素、8-羟基脱氧鸟苷(8-OHdG)表达变化及其与认知功能的相关性,通过选取本院2016年2月至2017年2月收治的2型糖尿病患者作为研究对象,根据有无认知功能损害分为2组,并选取同期100名健康体检者。检查入组人群血浆脂联素、8-OHdG水平,并对临床资料进行分析。结果发现糖尿病患者血浆脂联素、8-OHdG水平高于健康人群(p0.05);糖尿病伴认知功能障碍患者血浆脂联素、8-OHdG水平高于糖尿病患者(p0.05)。糖尿病患者MMSE评分、MoCA评分、数字广度测验得分低于健康人群,连线测验完成时间高于人群(p0.05);糖尿病伴认知功能障碍患者MMSE评分、MoCA评分、数字广度测验得分低于糖尿病患者无认知功能障碍者,连线测验完成时间高于糖尿病患者无认知功能障碍者(p0.05)。经Spearman相关性分析,发现2型糖尿病患者MoCA评分与年龄、BMI、糖尿病病程、空腹血糖、HBA1c、血浆脂联素水平、血浆8-OHdG水平呈负相关,与受教育年限呈正相关(p0.05)。结果说明2型糖尿病伴认知功能障碍患者血浆脂联素、8-OHdG水平升高,且与患者认知功能呈负相关;临床中可通过检测血浆脂联素、8-OHdG水平,对糖尿病患者认知功能进行初步评估,以指导后续治疗。     

蚕豆保卫细胞中ABA响应蛋白基因的转录

植物在不同的逆境条件下可以生成一类受脱落酸（ABA）诱导的蛋白质［脱落酸响应蛋白（ABAresPonsiveProtein，RABpr。tein）］（Bray1993）。RAB蛋白分布在不同的物种之中，许多［如Lea（Lateembryogen－。isabundant）蛋白（Dure1993）］形成于植物胚胎成熟失水过程中，但也有一些是植物受到不同逆境处理后在营养器官内所形成的「如脱水蛋白（Dehrdrin）］（Dure1993）。已发现的70余个RAB蛋白中，有30余个属于脱水蛋白。（Close等1993）RAB蛋白在植物体内的功能目前尚不了解（Bray1993）。由蛋白质的氨基酸组成分析表明，这些…     

大冢制药公司在美国建新所着手细胞表面糖链的研究

大塚制药公司在美国开设的第2个生物所已确定明年2—3月起正式发展工作,主要进行阐明利用单克隆抗体的细胞表面糖链结构等项研究。这个研究所与基因操作中心的大冢马里兰工程研究所一起,建成在美国的从事细胞工程和基因工程研究的基地。